Ниндзюцу включает в себя обширный перечень стратегических средств введения в заблуждение и маскировочной техники, предназначенных для дезориентации противника и недопущения разоблачения. Эффективность указанных средств обеспечивается, помимо прочего, широким набором специальных инструментов и оружия. Лиц, в полной мере овладевших техникой ниндзюцу, именуют ниндзя.
Легенды относят происхождение ниндзюцу к глубокой японской древности. На самом деле, однако, лишь во время ожесточенных средневековых войн (середина XII - XVI вв.) это боевое искусство стало неотъемлемой частью явных и тайных военных операций. Высшей точки своего расцвета ниндзюцу достигло в так называемый период воюющих государств (Сэнгоку), продолжавшийся с 1467 по 1568 г. Именно тогда появились знаменитые банды ниндзя, принадлежавшие к таким школам, как Ига и Кога, которые оперировали, соответственно, с территорий, являющихся ныне префектурами Миэ и Сига.
В период Эдо (1600 - 1868), когда представителям семейства Токугава удалось установить в стране прочный мир, ниндзюцу и его специалисты оказались перед угрозой превращения в никому не нужный анахронизм. С целью хоть как - то противостоять этой угрозе приверженцы ниндзюцу систематизировали его принципы в качестве боевого искусства и кодифицировали в письменном виде его технические приемы, инструменты и оружие (раньше все эти атрибуты в абсолютной тайне передавались от поколения к поколению изустно).
Одним из наиболее известных руководств по ниндзюцу является Мансэн сюкай (1676), составленный Самудзи Фудзибаяси и вобравший в себя традиции и приемы упомянутых школ Ига и Кога.